بررسی خصوصیات فنوتیپی و تنوع ژنتیکی جدایه های p‏seudomonas syringae pv. syringae عامل شانکر باکتریایی بادام در استان خراسان رضوی با استفاده از box-pcr

شانکر باکتریایی که بوسیله پاتوار­های pseudomonas syringae van hallایجاد می­شود یکی از مشکلات جدی باغ­های درختان میوه هسته­دار می­باشد. در این تحقیق طی سال­های 1391-1390 نمونه های دارای علائم شانکر از باغات بادام در استان خراسان رضوی جمع آوری شده و جداسازی باکتری انجام شد. عامل بیماری براساس آزمون­های گروه lopat و gatta، (pss)pseudomonas syringae pv. syringae  شناسایی شد. شانزده جدایه خالص ­سازی شده و مورد بررسی­های فیزیولوژیکی و بیوشیمیایی قرار گرفتند. جدایه­ها براین اساس اختلافات جزئی نشان دادند. تشخیص مولکولی جدایه ها با واکنش زنجیره ای پلی­مراز با آغازگرهای اختصاصی d21 و d22 صورت گرفت. به منظور ارزیابی دامنه تنوع ژنتیکی جدایه­ها، از روش box-pcr استفاده شد. از ضریب تشابه جاکارد (jaccard) برای تعیین تشابه جدایه­ها و از روش upgma و نرم افزار ntysys-pc برای آنالیز خوشه­ای استفاده شد. در آنالیز خوشه­ای داده­ها، جدایه­ها با آغازگر boxa1r در سطح تشابه 68 درصد، در 3 گروه قرار گرفتند. نتایج، بیانگر تنوع ژنتیکی جدایه­های عامل بیماری شانکر درختان بادام در استان خراسان رضوی است.